一种莲藕酚类化合物指纹图谱的构建方法,其特征在于,包括如下步骤:1)莲藕洗净后切分为藕段和藕节,藕段刨取皮部,藕节切除须根,得到藕皮和藕节两种供试部位,分别粉碎至5#20目待用;2)将步骤1)中粉碎的藕皮和藕节分别进行酚类化合物浸提处理,得藕皮酚类化合物供试液和藕节酚类化合物供试液;3)以步骤2)得到的藕皮酚类化合物供试液和藕节酚类化合物供试液为试样,分别进行高效液体色谱检测,得藕皮酚类化合物指纹图谱和藕节酚类化合物指纹图谱;4)重复步骤1)、2)和3)分别得到多个不同品种莲藕的藕皮和藕节相应的酚类化合物指纹图谱,通过Chempattern软件进行指纹图谱的比对分析,分别确定8个共有峰,并以共有峰分别建立藕皮酚类化合物标准指纹图谱和藕节酚类化合物标准指纹图谱。