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大麦BAC文库三维混合池的构建与HvGW2筛选

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成果类型:
期刊论文
作者:
郭刚刚;董国清;周进;达瓦顿珠;袁兴淼;...
作者机构:
[郭刚刚; 周进; 达瓦顿珠; 袁兴淼; 张京] 中国农业科学院作物科学研究所
[董国清] 武汉工业学院
语种:
中文
关键词:
大麦;BAC文库;三维混合池;粒重基因
关键词(英文):
HvGW2
期刊:
中国农业科学
ISSN:
0578-1752
年:
2013
卷:
46
期:
1
页码:
9-17
基金类别:
国家“863”计划项目(2012AA101105-4); 国家“十二五”科技支撑计划(2012BAD03B01-2); 国家现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-05);
机构署名:
本校为第一机构
摘要:
【目的】从大麦BAC文库中快速筛选包含目的基因HvGW2的阳性BAC克隆。【方法】构建BAC文库三维混合池,设计2对HvGW2特异性引物,进行BAC文库筛选,对含有目的基因HvGW2的阳性BAC克隆进行测序,获得编码大麦GW2蛋白的基因组DNA序列,并与禾本科中的GW2进行同源进化分析。【结果】构建了大麦BAC文库的三维混合池160个,文库空载率为0.18%;筛选到含HvGW2的阳性BAC克隆3个,其中,BAC克隆196M02包含完整编码该基因的序列;HvGW2包含8个外显子和7个内含子,具有与其它植物GW2相似的结构特征和保守的功能结构域;同源进化分析结果显示,大麦与小麦的GW2蛋白同源性最高;序列分析发现,HvGW2第6内含子上包含2个不同类...
摘要(英文):
[Objective] The objective of this study was to isolate HvGW2 gene from barley BAC library rapidly. [Method] Three-dimensional (3D) BAC pools were constructed and screened by using barley GW2 gene-specific PCR primers. Positive BAC clones were screened out and further sequenced, the obtained HvGW2 gene was used for homologous evolutionary analysis with those of other grasses. [Result] One hundred and sixty BAC DNA pools were prepared by 3D pooling strategy from barley BAC library with only 0.18% of empty clones. PCR-based screening demonstrate...

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